يتميز داخل كنيسة القديسة مريم العذراء في مارجرجس (مصر القديمة) بصحن مركزي واسع تصطف على جانبيه مقاعد خشبية منحوتة، وممر مفروش بسجادة حمراء يمتد نحو الهيكل المزخرف والأيقونسطاس. تتزين الجدران بنوافذ ذات زجاج ملون مقوسة ضمن تشطيب خشبي دافئ، فيما يعلو السقف الخشبي مروحتان سقفيتان وثريا مركزية. تقع هذه الكنيسة القبطية الأرثوذكسية في حي مصر القديمة التاريخي، أحد أبرز مواقع التراث المسيحي المبكر في مصر.